Ce marais, fortement soumis à des pressions anthropiques, s’est retrouvé enclavé dans le tissu urbain mais rend aujourd’hui des services éco-systémique considérables. Cette zone humide est un véritable réservoir de biodiversité et une zone de quiétude pour un bon nombre d’espèces. Le marais de Pontaillac s’inscrit dans un grand ensemble urbanisé, tout en offrant de vastes perceptions sur de grands ensembles arborés et espaces prairiaux, sans, toutefois, offrir des vues très lointaines sur le littoral plutôt proche Ces habitats de zones humides, sont en régression dans toute la France et ont une forte valeur patrimoniale. La faune du Marais de Pontaillac est riche au regard de sa superficie. Cette zone humide permet d’accueillir des espèces menacées au niveau mondial comme l’Anguille européenne), le Brochet d’Aquitaine, le Campagnol amphibie et le très rare Maillot Des Moulins (petit mollusque). Un papillon rhopalocère, présent dans les prairies du Marais de Pontaillac, l’Hespérie du Chiendent est considéré comme quasi menacé à la liste rouge européenne de l’UICN. La Cistude d’Europe (tortue d’eau douce) et l’Agrion de Mercure considérés comme quasi menacées à l’échelle mondiale font également la richesse de ce site. D’autres espèces menacées liées aux zones humides sont présents dans les prairies comme le Criquet ensanglanté et le Criquet tricolore mais aussi dans les fossés comme l’Agrion joli. Le Marais de Pontaillac héberge une flore typique des marais (plus de 250 espèces végétales), dont en particulier des prairies tourbeuses avec des espèces d’Orchidées, tel que l’Orchis des Marais avec une population oscillant entre 100 et 200 pieds. Le site héberge la seule station connue du département de Cresson à petites feuilles. De nombreuses espèces présentes sur le site tel que : la Renoncule à feuilles d’Ophioglosse, l’Ophioglosse commun, la Fougère des marais, l’Hottonie des marais, le Cornifle submergé, et le Potamot des tourbières alcalines, sont des espèces en grande raréfaction en France.

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